Artificial intelligence (AI) and the discovery of novel antibiotics - with Jonathan Stokes

Jonathan Stokes and his colleagues are discovering novel antibiotics through artificial intelligence (AI) - among others Halicin and Abaucin. This AI-driven research was named one of the years top discoveries by The New York Times in 2023. Stay tuned for a very futuristic - and inspiring - interview with a very interesting researcher!References: Swanson, K., Liu, G., Catacutan, D.B. et al. Generative AI for designing and validating easily synthesizable and structurally novel antibiotics. Nat Mach Intell 6, 338–353 (2024).Lluka T, Stokes JM. Antibiotic discovery in the artificial intelligence era. Ann N Y Acad Sci. 2023 Jan;1519(1):74-93. doi: Liu G, Catacutan DB, Rathod K, Swanson K, Jin W, Mohammed JC, et al. Deep learning-guided discovery of an antibiotic targeting Acinetobacter baumannii. Nature Chemical Biology. 2023;19(11):1342-50.Stokes JM, Yang K, Swanson K, Jin W, Cubillos-Ruiz A, Donghia NM, et al. A Deep Learning Approach to Antibiotic Discovery. Cell. 2020;180(4):688-702.e13. Awan RE, Zainab S, Yousuf FJ, Mughal S. AI-driven drug discovery: Exploring Abaucin as a promising treatment against multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. Health Sci Rep. 2024;7(6):e2150. Higashihira S, Simpson SJ, Morita A, Suryavanshi JR, Arnold CJ, Natoli RM, Greenfield EM. Halicin remains active against Staphylococcus aureus in biofilms grown on orthopaedically relevant substrates. Bone Joint Res. 2024 Mar 4;13(3):101-109. doi: 10.1302/2046-3758.133.BJR-2023-0038.R2. PMID: 38432258; PMCID: PMC10909403. Hosted on Acast. See acast.com/privacy for more information.

Om Podcasten

Pest-podden - ein podkast for deg som vil bli infeksjons- eller tropemedisiner i verdas minst tropiske land. Eller berre lære deg meir infeksjonsmedisin.  «Why does the fungi have so many friends? – Because he is a fun guy!»  Akkurat sånn tenker vi, Jørgen og Ingrid, om infeksjonsmedisinen òg – kanskje det faget innafor medisin med flest spanande bakgrunnshistorier og sjanser for krumspring, avsporingar- (og påsporingar), irrgangar, sidevegar, avstikkarar inn i jungelen og oppsiktsvekkande oppdagingar.  Vi gjer eit forsøk på å gjere det vanskelege enkelt og det keisame morosamt – på norsk, sia nesten alle infeksjonsmedisinske podcastar i dag er engelskspråklige, og følgjeleg òg altfor fulle av meropenem. I denne podcasten får du med andre ord dårlege vitsar, gode historier og spontane innfall – men forhåpentligvis med eit visst læringsutbytte på reisa. Vi er Ingrid Hoff og Jørgen Østensjø – snart ferdige spesialistar i infeksjonsmedisin. I tillegg har vi med oss LIS3 i indremedisin Nikolai Norevik Myklebust som ikkje er spesialist no i næraste framtid, men det er berre fordi han måtte gå på Griegakademiet, bli ferdig utdanna jazzmusikar, og så skrive musikken til Pestpodden først. Ris og ros, tips til tema, vinkling eller intervjuer – vi tar imot alt med glede! Skriv til: pestpodden@helse-bergen.no. Ein stor takk rettast til leiar for tropesenteret og førsteamanuensis Kristine Mørch og til seksjonsoverlege Trond Bruun. Takk til Norsk forening for infeksjonsmedisin òg, som vi gleder oss til å samarbeide med i framtida.All musikk er av Nikolai Norevik Myklebust, produsent er Marius Løbø Fimland - Helse Bergen HF. Hosted on Acast. See acast.com/privacy for more information.